根據(jù)《國務(wù)院辦公廳轉(zhuǎn)發(fā)科技部等部門關(guān)于國家經(jīng)貿(mào)委管理的10個(gè)國家局所屬科研機(jī)構(gòu)管理體制改革意見的通知》（國辦發(fā)[1999]18號），現(xiàn)對國家經(jīng)貿(mào)委管理的內(nèi)貿(mào)局、煤炭局、機(jī)械局、冶金局、石化局、輕工局、建材局、煙草局、有色金屬局等10個(gè)國家局所屬242個(gè)科研機(jī)構(gòu)的管理體制改革，提出實(shí)施意見如下：
　　一、實(shí)施方案
　?。ㄒ唬?42個(gè)科研機(jī)構(gòu)按照實(shí)現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的總體要求，從實(shí)際情況出發(fā)，自主選擇改革方式，包括轉(zhuǎn)變成科技型企業(yè)、整體或部分進(jìn)入企業(yè)和轉(zhuǎn)為技術(shù)服務(wù)與中介機(jī)構(gòu)等。經(jīng)國家批準(zhǔn)繼續(xù)保留事業(yè)單位性質(zhì)的少數(shù)科研機(jī)構(gòu)，也要引進(jìn)科技型企業(yè)運(yùn)行機(jī)制。
　?。ǘ┛蒲袡C(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制時(shí)，按照有關(guān)法律、法規(guī)的要求，其現(xiàn)有全部國有資產(chǎn)（包括土地使用權(quán)）轉(zhuǎn)為國有資本金。
　?。ㄈ┛蒲袡C(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制為科技型企業(yè)時(shí)，要在工商行政管理部門登記注冊為企業(yè)法人；有條件的可以依照《中華人民共和國公司法》改制為有限責(zé)任公司或股份有限公司；注冊名稱可用原科研機(jī)構(gòu)名稱（去掉原主管部門）或用符合登記規(guī)定的其他名稱。
　　科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制為科技型企業(yè)并實(shí)行屬地化管理的，要到所在省、自治區(qū)、直轄市工商行政管理部門登記注冊，其國有資產(chǎn)、人員編制、勞動(dòng)工資等均劃歸地方政府管理。其中規(guī)模較大的，在改制后5年過渡期內(nèi)，可由地方政府代表、國務(wù)院有關(guān)部門代表、有資金注入的相關(guān)行業(yè)骨干企業(yè)代表和本單位代表組成理事會(huì)。理事會(huì)的主要職責(zé)是，確定企業(yè)的發(fā)展方向和主要領(lǐng)導(dǎo)人的人選。
　　對少數(shù)轉(zhuǎn)制為中央直屬大型科技型企業(yè)，由原主管國家局推薦，經(jīng)科技部、國家經(jīng)貿(mào)委、人事部審核并報(bào)國務(wù)院批準(zhǔn)后，到國家工商行政管理部門登記注冊；其子公司或子企業(yè)以及直屬分支機(jī)構(gòu)到所在省、自治區(qū)、直轄市工商行政管理部門登記注冊。其資產(chǎn)管理及有關(guān)財(cái)務(wù)關(guān)系交由財(cái)政部負(fù)責(zé)，領(lǐng)導(dǎo)干部的職務(wù)交由中央大型企業(yè)工委、人事部管理。
　　科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制為科技型企業(yè)后，要建立現(xiàn)代企業(yè)制度，按社會(huì)主義市場經(jīng)濟(jì)的新機(jī)制運(yùn)行，在經(jīng)營、管理方面依法享有充分的自主權(quán)。同時(shí)，要加強(qiáng)研究開發(fā)工作，保持企業(yè)的持續(xù)創(chuàng)新能力。
　　（四）科研機(jī)構(gòu)進(jìn)入企業(yè)后，可作為企業(yè)的技術(shù)開發(fā)機(jī)構(gòu)、子公司或其他分支機(jī)構(gòu)。進(jìn)入國有獨(dú)資企業(yè)的，其國有資產(chǎn)劃轉(zhuǎn)給所進(jìn)企業(yè)；進(jìn)入其他企業(yè)的，其資產(chǎn)評估后作為國有資產(chǎn)投資，由地方政府對投入的國有資產(chǎn)進(jìn)行監(jiān)督。
　?。ㄎ澹┥贁?shù)科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)為技術(shù)服務(wù)與中介機(jī)構(gòu)的，經(jīng)國家批準(zhǔn)，可保留事業(yè)單位性質(zhì)，實(shí)行企業(yè)化運(yùn)營。按照屬地化原則，這類機(jī)構(gòu)原則上交由所在省、自治區(qū)、直轄市政府管理，其資產(chǎn)、人員編制和經(jīng)費(fèi)同時(shí)劃轉(zhuǎn)。
　　（六）科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后，國家確認(rèn)的技術(shù)認(rèn)證和質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)中心、進(jìn)出口商檢中心，要保持相關(guān)機(jī)構(gòu)和人員的穩(wěn)定，經(jīng)國務(wù)院有關(guān)部門審核認(rèn)定后，繼續(xù)承擔(dān)國家交給的任務(wù)，接受國務(wù)院有關(guān)部門的監(jiān)督和業(yè)務(wù)指導(dǎo)，以保持其開展相關(guān)業(yè)務(wù)的公正性。對這類中心，國家財(cái)政繼續(xù)給予必要的經(jīng)費(fèi)支持。具體改革管理辦法由科技部會(huì)同質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局、國家經(jīng)貿(mào)委、財(cái)政部等另行制定。
　　（七）科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后，原具有學(xué)位授予權(quán)的，繼續(xù)列入國家招生計(jì)劃招收研究生，報(bào)國務(wù)院學(xué)位委員會(huì)備案。研究生的培養(yǎng)要加強(qiáng)與高校的聯(lián)合，基礎(chǔ)課的授課任務(wù)可委托相關(guān)高校承擔(dān)。
　?。ò耍┰谵D(zhuǎn)制期間，242個(gè)科研機(jī)構(gòu)的現(xiàn)有領(lǐng)導(dǎo)班子要保持相對穩(wěn)定，確保國有資產(chǎn)不流失，日常工作仍以國家局管理為主。
　?。ň牛┛蒲袡C(jī)構(gòu)不得違反國家有關(guān)規(guī)定辦理職工退休手續(xù)。
　　二、配套政策
　　科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制后，享受以下優(yōu)惠政策：
　?。ㄒ唬┰械恼Ｊ聵I(yè)費(fèi)繼續(xù)撥付，主要用于解決轉(zhuǎn)制前已經(jīng)離退休人員的社會(huì)保障問題。
　　（二）職工養(yǎng)老保障按以下辦法執(zhí)行：
　　轉(zhuǎn)制前已經(jīng)離退休的人員，原離退休金計(jì)發(fā)辦法不變，離退休金發(fā)放和日常管理工作由原單位負(fù)責(zé)。
　　轉(zhuǎn)制后的在職人員實(shí)行企業(yè)職工基本養(yǎng)老保險(xiǎn)制度。從1999年7月1日起，單位和個(gè)人按當(dāng)?shù)厝嗣裾?guī)定的比例繳納基本養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)，建立基本養(yǎng)老保險(xiǎn)個(gè)人賬戶。1999年7月1日前的連續(xù)工齡視同繳費(fèi)年限，不再補(bǔ)繳養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)。
　　轉(zhuǎn)制前參加工作、轉(zhuǎn)制后退休的人員，基本養(yǎng)老金計(jì)發(fā)按照企業(yè)職工基本養(yǎng)老保險(xiǎn)制度的規(guī)定執(zhí)行，對按企業(yè)基本養(yǎng)老金計(jì)發(fā)辦法低于原事業(yè)單位退休金計(jì)發(fā)辦法的部分，采用發(fā)補(bǔ)貼的辦法解決，所需費(fèi)用從基本養(yǎng)老保險(xiǎn)統(tǒng)籌基金中支付，補(bǔ)貼標(biāo)準(zhǔn)按國家有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。2004年7月1日后退休的，執(zhí)行企業(yè)會(huì)計(jì)發(fā)辦法。有條件的企業(yè)可建立補(bǔ)充養(yǎng)老保險(xiǎn)。企業(yè)要高度重視并保證科技人員退休后應(yīng)有的生活待遇。
　　轉(zhuǎn)制后參加工作的人員，按照規(guī)定執(zhí)行當(dāng)?shù)仄髽I(yè)職工基本養(yǎng)老保險(xiǎn)制度。
　　（三）基本建設(shè)項(xiàng)目投資由國家經(jīng)貿(mào)委、科技部和有關(guān)國家局商國家計(jì)委在過去5年平均水平的基礎(chǔ)上，結(jié)合在建項(xiàng)目的實(shí)際情況，繼續(xù)由中央給予兩年補(bǔ)助支持。
　　（四）從1999年起5年內(nèi)，免征企業(yè)所得稅，免征其技術(shù)轉(zhuǎn)讓收入的營業(yè)稅，免征其科研開發(fā)自用土地的城鎮(zhèn)土地使用稅?？蒲袡C(jī)構(gòu)進(jìn)入企業(yè)仍然從事科技開發(fā)并實(shí)行獨(dú)立經(jīng)濟(jì)核算的，享有上述同等免稅政策。
　?。ㄎ澹┫碛凶誀I進(jìn)出口權(quán)。
　?。┫硎車抑С挚萍夹推髽I(yè)的待遇。
　?。ㄆ撸﹨⒓訃铱蒲姓n題和項(xiàng)目的申請、競標(biāo)享有與其他科研機(jī)構(gòu)同等的權(quán)利。
　　（八）已經(jīng)批準(zhǔn)的科研課題和項(xiàng)目繼續(xù)按原計(jì)劃實(shí)施。
　　三、組織實(shí)施
　　此項(xiàng)改革工作在國務(wù)院領(lǐng)導(dǎo)下，由國家經(jīng)貿(mào)委、科技部會(huì)同10個(gè)國家局組織實(shí)施。各有關(guān)部門要認(rèn)真負(fù)責(zé)、積極穩(wěn)妥地做好工作，確保轉(zhuǎn)制工作按期完成。
　?。ㄒ唬?0個(gè)國家局要指定專門辦事機(jī)構(gòu)，精心組織，制定所屬科研機(jī)構(gòu)的改革方案，在轉(zhuǎn)制過渡期內(nèi)，尤其要做好細(xì)致的思想政治工作，確保改革的順利進(jìn)行。
　?。ǘ┛萍疾俊医?jīng)貿(mào)委會(huì)同有關(guān)部門做好改革方案的協(xié)調(diào)和審核工作，監(jiān)督改革相關(guān)政策的執(zhí)行情況，及時(shí)協(xié)調(diào)解決改革過程中出現(xiàn)的有關(guān)問題。對轉(zhuǎn)制過程中遇到的重大問題及時(shí)向國務(wù)院匯報(bào)。
　　（三）有關(guān)地方政府要認(rèn)真做好接納科研機(jī)構(gòu)的工作，妥善解決他們的困難，重視發(fā)揮他們的優(yōu)勢，加速科技產(chǎn)業(yè)化。不得隨意向這些單位安插人員，確保轉(zhuǎn)制工作高質(zhì)量、高效率、如期完成。
　?。ㄋ模﹪鴦?wù)院各有關(guān)部門要顧全大局，密切配合，不推諉、不扯皮、特事特辦，盡職盡責(zé)地對科研機(jī)構(gòu)的改革給予大力支持。
　　（五）改革實(shí)施的進(jìn)度安排：
　　1.1999年3月份啟動(dòng)并開展工作；
　　2.4月10日前，10個(gè)國家局要將所屬科研機(jī)構(gòu)轉(zhuǎn)制方案報(bào)科技部、國家經(jīng)貿(mào)委匯總審核；由科技部、國家經(jīng)貿(mào)委、中編辦、財(cái)政部商有關(guān)部門，將審核后的轉(zhuǎn)制方案于4月25日前報(bào)國務(wù)院審批；
　　3.轉(zhuǎn)制方案經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)后，由國家經(jīng)貿(mào)委及10個(gè)國家局負(fù)責(zé)在6月30日以前，完成所屬242科研機(jī)構(gòu)的轉(zhuǎn)制工作。7月1日開始按新的管理體制運(yùn)行。
　　完成轉(zhuǎn)制工作的標(biāo)志是：國務(wù)院批準(zhǔn)科技部、國家經(jīng)貿(mào)委、中編辦、財(cái)政部上報(bào)的轉(zhuǎn)制方案并辦理完移交手續(xù)。對于清產(chǎn)核資、資產(chǎn)劃撥、工商登記注冊等具體手續(xù)，可適當(dāng)延長一些時(shí)間，由國家經(jīng)貿(mào)委、科技部、10個(gè)國家局以及有關(guān)部門協(xié)助抓緊進(jìn)行。
　　本實(shí)施意見由科技部負(fù)責(zé)解釋。